En la cueva número uno se encontró una copia casi completa de un comentario sobre los dos primeros capítulos de Habacuc.
También se han conservado fragmentos de comentarios sobre Salmos, Isaías, Nahúm y Miqueas.
Estas dos obras muestran un tipo especial de interpretación bíblica en la cual se aplican las palabras de los profetas a la secta y los tiempos en los cuales ésta floreció.
Con frecuencia se denomina "Maestro de justicia" a su dirigente, y "Sacerdote impío" a su principal antagonista. Los caldeos de Habacuc 1:6 son denominados quitim, y se insinúa que son los romanos.
Además de los comentarios de libros bíblicos han aparecido colecciones (florilegios) de pasajes bíblicos con sus correspondientes comentarios.